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非人靈長(zhǎng)類動(dòng)物完整染色體序列首次發(fā)布

2024-05-30 10:55:48  |  來 源:科技日?qǐng)?bào)  點(diǎn)擊:

由美國(guó)賓夕法尼亞州立大學(xué)和美國(guó)國(guó)家人類基因組研究所領(lǐng)導(dǎo)的國(guó)際合作小組首次生成了非人靈長(zhǎng)類動(dòng)物的完整染色體序列,相關(guān)論文發(fā)表在29日的《自然》雜志上。這些序列揭示了不同物種Y染色體之間的顯著差異,顯示出它們快速進(jìn)化的歷史,還揭示了以前未被研究過的類人猿基因組區(qū)域,為物種多樣性和進(jìn)化提供了重要見解。

靈長(zhǎng)類物種是現(xiàn)存與人類最接近的“親戚”。此次,研究人員對(duì)黑猩猩、倭黑猩猩、大猩猩、婆羅洲猩猩、蘇門答臘猩猩,以及另一種與人類關(guān)系較遠(yuǎn)的靈長(zhǎng)類物種——合趾猿的染色體進(jìn)行了測(cè)序,重點(diǎn)研究了它們的X和Y染色體。

結(jié)果發(fā)現(xiàn),在6種猿類中,Y染色體在各種特征(包括大?。┥系淖儺愋远急萖染色體大得多。X染色體所含核苷酸字母的數(shù)量從黑猩猩的1.54億個(gè)到大猩猩的1.78億個(gè)不等,相差約2400萬;相比之下,Y染色體所含核苷酸字母數(shù)量從合趾猿的3000萬個(gè)到蘇門答臘猩猩的6800萬個(gè)不等,相差約3800萬。

物種間共享的DNA序列數(shù)量在Y染色體上也更具可變性。為了將猿類染色體序列與人類X和Y染色體進(jìn)行比較,研究人員使用了一種名為“比對(duì)”的計(jì)算方法。

深圳華大生命科學(xué)研究院副院長(zhǎng)金鑫在接受科技日?qǐng)?bào)記者采訪時(shí)說:“比對(duì)指的是一段序列與另一段序列的比較。如果相似度比較高,我們就說‘比對(duì)成功’,或‘比對(duì)上了’。”

研究發(fā)現(xiàn),超過90%的猿類X染色體序列與人類X染色體比對(duì)成功,表明X染色體在數(shù)百萬年的發(fā)展過程中進(jìn)化速度較慢。相比之下,只有14%—27%的猿類Y染色體序列與人類Y染色體比對(duì)成功。

此外,在Y染色體上,重復(fù)序列所占染色體的百分比變化也很大。根據(jù)物種的不同,重復(fù)序列占X染色體的62%—66%,而占Y染色體的71%—85%。

該研究帶頭人、賓夕法尼亞州立大學(xué)教授卡捷琳娜·馬科娃表示,這些物種的Y染色體差異之大令人非常驚訝。其中一些物種僅在700萬年前才從人類譜系中分化出來,從進(jìn)化角度來看,這一時(shí)間并不長(zhǎng),這表明Y染色體進(jìn)化得非常快。


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