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多組學(xué)研究識(shí)別出結(jié)直腸癌關(guān)鍵預(yù)后因子

2024-08-09 10:20:00  |  來 源:科技日?qǐng)?bào)  點(diǎn)擊:

科技日?qǐng)?bào)深圳8月8日電 (記者羅云鵬)8日,記者從深圳華大生命科學(xué)研究院獲悉,該院與瑞典烏普薩拉大學(xué)、華大基因智惠醫(yī)學(xué)研究院等合作,通過對(duì)瑞典1063例結(jié)直腸癌樣本進(jìn)行全基因組及轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析,發(fā)現(xiàn)一系列與癌癥不同階段相關(guān)的基因。研究還識(shí)別出結(jié)直腸癌關(guān)鍵預(yù)后因子,為結(jié)直腸癌的預(yù)防、治療及預(yù)后提供了數(shù)據(jù)基礎(chǔ)。相關(guān)成果7日發(fā)表在《自然》上。

烏普薩拉大學(xué)教授托比亞斯·斯格羅姆認(rèn)為,這項(xiàng)研究實(shí)現(xiàn)了迄今為止最大規(guī)模的結(jié)直腸癌基因組和轉(zhuǎn)錄組綜合分析,并將分子層面的發(fā)現(xiàn)與高質(zhì)量的臨床數(shù)據(jù)相結(jié)合,從而識(shí)別出關(guān)鍵預(yù)后因子。這是與其他絕大多數(shù)癌癥基因組學(xué)研究的不同之處。

研究人員通過全基因組和轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析發(fā)現(xiàn),在線粒體基因組和非編碼區(qū)域中亦存在與疾病相關(guān)突變,填補(bǔ)了相關(guān)研究的空白,將進(jìn)一步推動(dòng)對(duì)結(jié)直腸癌發(fā)病機(jī)制的理解。

同時(shí),研究團(tuán)隊(duì)將同一腫瘤樣本基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行整合分析后發(fā)現(xiàn),無論是否為微衛(wèi)星不穩(wěn)定性腫瘤,其抑癌基因上的突變均導(dǎo)致基因表達(dá)降低,從而更容易患癌。

此外,研究團(tuán)隊(duì)基于腫瘤基因表達(dá)差異,將結(jié)直腸癌預(yù)后分為5個(gè)預(yù)后亞型。相較于結(jié)直腸癌經(jīng)典的共識(shí)分子分型,本研究構(gòu)建的亞型能更加準(zhǔn)確地預(yù)測(cè)預(yù)后。

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